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阿飞与安达

每天进步一点点!

 
 
 
 
 
 

[置顶] 2014年06月23日

2014-6-23 13:05:32 阅读551 评论0 232014/06 June23

作者  | 2014-6-23 13:05:32 | 阅读(551) |评论(0) | 阅读全文>>

用R语言绘制韦恩图

2013-11-15 14:37:06 阅读3712 评论0 152013/11 Nov15

R中提供了多个可用于绘制韦恩图的软件包,本文主要是介绍的是VennDiagram包。

安装VennDiagram包:

install.packages("VennDiagram")

首先加载相应的软件包:

library(VennDiagram)

生成几个集合并计算各个集合及其相互交集的大小:

A = 1:150

B = c(121:170,300:320)

C = c(20:40,141:200)

Length_A<-length(A)

Length_B<-length(B)

Length_C<-length(C)

Length_AB<-length(intersect(A,B))

Length_BC<-length(intersect(B,C))

Length_AC<-length(intersect(A,C))

Length_ABC<-length(intersect(intersect(A,B),C))

利用通用函数venn.diagram绘制两个集合的韦恩图:

T<-venn.diagram(list(A=A,B=B),filename=NULL

,lwd=1,lty=2

,col=c('red','green'),fill=c('red','green')

作者  | 2013-11-15 14:37:06 | 阅读(3712) |评论(0) | 阅读全文>>

作者  | 2013-8-21 15:48:53 | 阅读(279) |评论(0) | 阅读全文>>

SAM文件格式说明

2013-3-23 15:17:40 阅读3621 评论0 232013/03 Mar23

SAM文件定义

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。

不同的软件,不同的时期,不同的研究方向,都会创建一种或者多种格式标准,当然根据当时的需要,创建符合需求的标准,也是最容易的事情,而反过来想 要真正的理解标准,也必须理解为什么要创建这样的标准,解决什么样的需要。我前面的有篇文章已经对于现有的多重比对的格式进行总结,但其更多的站在比较基 因组学的角度。当我们去了解sam标准格式是什么的时候,就要思考既然以及有了这么多得标准,为什么还要定义SAM标准,当然拿所有的格式进行比较也并非 易事,但是简单的对比,就可以了解其中一二,比如aln格式,是比对视图化的展示,存储的信息不够结构化,无法方便的作为另外程序的输入;表示信息的有限 性,如果100个多重比对序列放到一个文件中,查看维护就会非常困难;还有些格式标准挺强大,但是太繁琐,同时不够灵活。那么反过来就是SAM格式的优 点,那么SAM如何做到这一点的呢?

SAM要处理好的问题:

·         非常多序列(read),mapping到多个参考基因组(reference)上;

·         同一条序列,分多段(segment)比对到参考基因组上;

·

作者  | 2013-3-23 15:17:40 | 阅读(3621) |评论(0) | 阅读全文>>

雷诺汽车广告设计 | 当最后一粒沙结束之时 我们将到达下个景点!

将概念与现实相结合的广告设计!非常有创意啊!哈哈~献给有沙漏控的孩子们!

雷诺汽车广告设计 | 当最后一粒沙结束之时 我们将到达下个景点!

如果觉得我们的分享不错!

请点击左下角的“推荐”以便让更多的人看到好的设计!

Thanks

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作者  | 2013-1-7 20:33:41 | 阅读(281) |评论(0) | 阅读全文>>

【转载】2012优秀平面广告大回顾

2013-1-7 20:19:14 阅读327 评论0 72013/01 Jan7

一年说短也有365天,说长似乎也一眨目艮就又逢跨年,每年都有2012精採新闻前10名、2012关键渍排行榜、2012网路平台大事件等等话题苛以回顾,那2012年又繒经出现过什麼优秀dē广告创意呢?让ω哦们继续看下去…

▲快速帮你消除脂肪的减肥广告,利用橡皮擦的概念把油腻腻的腊肠擦除变成营养健康的香蕉。

▲做瑜伽不只可以帮你雕塑美好身材,还可以让你丢掉工作的烦恼,扰人的购物慾和L号的大牛仔裤。

▲一间技巧卓越的美容院可以帮你把头发变成超酷的装饰品。

▲这罐沐浴乳在你洗澡的时候好像顺便帮你按摩每吋肌肤。(但是好惊悚喔…!)

▲可口可乐在奥运。

▲巴黎的迪士尼乐园欢庆圣诞节。(有找到米老鼠在哪裡了吗?)

▲新的360度全景拍摄功能。

▲一个男人长了有如女人头发的鬍子…,欸不对喔,画面裡有两个人勒!

▲利用西瓜的纹路与音乐的音波做连结。

▲你累了吗?

▲麦当劳祝大家万圣节快乐!(不给汉堡就捣蛋XD)

▲才刚切好就马上调理好,超快速食物调理机。

▲吸收力卓越的超强抹布,所到之处不见水渍。

▲利用安全带把后面的年份遮住,概念来自於墓碑上的生日与忌日,提倡大家搭车都最好繫上安全带。

▲戴上这副眼镜,你的视力好比老鹰一样。

▲光看就觉得很酸的酸糖果广告。

▲「现在邮局开始卖咖啡了」,相当言简意该又典雅的广告。

▲搭上这般航班,巴西和纽约就是那麼近

作者  | 2013-1-7 20:19:14 | 阅读(327) |评论(0) | 阅读全文>>

如何将bash为csh

2012-11-4 14:48:30 阅读1254 评论0 42012/11 Nov4

修改/etc/passwd 文件中对应于用户的那一行的最后一项, 将'/bin/bash' 改为 '/bin/csh'

首先,以root身份登录,打开终端,输入

apt-get install csh/ksh    如果已经安装了csh,会提示已经安装了。

否则系统自动下载并安装csh,安装完成后在终端输入

chsh

提示

正在更改 root 的 SHELL

请输入新值,或直接敲回车键以使用默认值

登录 Shell [/bin/bash]:

输入

/bin/csh

修改bash为csh。重新起动ubuntu,并以root身份登录,打开终端,输入

# echo $SHELL

返回s“/bin/csh”,说明SHELL修改成功。

请输入新值,或直接敲回车键以使用默认值

登录 Shell [/bin/bash]:

输入

/bin/csh

修改bash为csh。重新起动ubuntu,并以root身份登录,打开终端,输入

# echo $SHELL

返回s“/bin/csh”,说明SHELL修改成功。

作者  | 2012-11-4 14:48:30 | 阅读(1254) |评论(0) | 阅读全文>>

英文自我介绍 三

2012-10-16 16:41:38 阅读293 评论0 162012/10 Oct16

英语面试实战指南 

 I:Interviewer(面试者)A:Applicant(求职者)

介绍教育背景:简明扼要,实话实说 

尽管你在简历中对自己的教育背景作了介绍,但在面试时,面试官还有可能就此方面提问。还是事先做点准备吧。 

①Iwhat is your major? 

ADuring the period of master, my major is Biochemistry and Molecular Biology. But my mainly research area is computer aided drug design.

(不仅回答了问题,还顺带一句介绍了自己较为感兴趣的方面,简明扼要。)

②IWhich university are you attending? 

AI am attending×××University.

③IHave you received any degrees? 

AYes. First, I received my Bachelor degree in English Literature and then an MBA degree.

④IWhat course did you like best? 

AProject Management. I was very

作者  | 2012-10-16 16:41:38 | 阅读(293) |评论(0) | 阅读全文>>

英文自我介绍二

2012-10-16 16:07:20 阅读541 评论0 162012/10 Oct16

Good morning ! It is really my honor to have this opportunity for an interview, I hope i can make a good performance today. I'm confident that I can succeed. Now i will introduce myself briefly. I am 26 years old, born in shandong province . I was graduated from qingdao university. my major is electronic. and i got my bachelor degree after my graduation in the year of 2003. I spend most of my time on study,i have passed CET4/6 . and i have acquired basic knowledge of my major during my school time. In July 2003, I began work for a small private company as a technical support engineer in QingDao city.Because I'm capable of more responsibilities, so I decided to change my job. And in August 2004,I

作者  | 2012-10-16 16:07:20 | 阅读(541) |评论(0) | 阅读全文>>

作者  | 2012-10-16 12:01:47 | 阅读(203) |评论(0) | 阅读全文>>

【转载】童鞋们,这个字大家认识不啊!

2012-10-11 12:02:40 阅读231 评论0 112012/10 Oct11

作者  | 2012-10-11 12:02:40 | 阅读(231) |评论(0) | 阅读全文>>

LogP

2012-8-30 11:03:33 阅读352 评论0 302012/08 Aug30

分配系数,分析化学概念之一。所谓分配定律是指一定温度下,物质A在两种互不相溶的溶剂中达到分配平衡时在两相中的活度(常近似为浓度)之比,即分配系数,为一常数。分配系数可用于表示该物质对两种溶剂的亲和性的差异。对分配系数的测定可提供该物质在环境行为方面许多重要的信息。

常用的溶剂体系是由水与一种与水不互溶的有机溶剂组成,如正辛醇-水体系,所得的分配系数称为辛醇-水分配系数()。之所以用辛醇是因为该体系近似于体内脂细胞膜-胞质溶胶体系对有机物的分配。

logP值指某物质在正辛烷(油)和水中的分配系数的对数值。反映了物质在油水两相中的分配情况。logP值越大,说明该物质越亲油,反之,越小,则越亲水,即水溶性越好

作者  | 2012-8-30 11:03:33 | 阅读(352) |评论(0) | 阅读全文>>

du命令使用示例

2012-8-23 16:02:17 阅读299 评论0 232012/08 Aug23

 1> 要显示一个目录树及其每个子树的磁盘使用情况   

du /home/linux   

这在/home/linux目录及其每个子目录中显示了磁盘块数。  

 2> 要通过以1024字节为单位显示一个目录树及其每个子树的磁盘使用情况   

du -k /home/linux   这在/home/linux目录及其每个子目录中显示了 1024 字节磁盘块数。

   3> 以MB为单位显示一个目录树及其每个子树的磁盘使用情况   

 du -m /home/linux   

  这在/home/linux目录及其每个子目录中显示了 MB 磁盘块数。   

 4> 以GB为单位显示一个目录树及其每个子树的磁盘使用情况   

du -g /home/linux   

这在/home/linux目录及其每个子目录中显示了 GB 磁盘块数。   

5>查看当前目录下所有目录以及子目录的大小:   

du -h .   

“.”代表当前目录下。也可以换成一个明确的路径   

-h表示用K、M、G的人性化形式显示   

6>查看当前目录下user目录的大小,并不想看其他目录以及其子目录:   

du -sh user   

-s表示总结的意思,即只列出一个总结的值   

作者  | 2012-8-23 16:02:17 | 阅读(299) |评论(0) | 阅读全文>>

蒂姆邓肯

2012-7-13 12:15:06 阅读221 评论0 132012/07 July13

作者  | 2012-7-13 12:15:06 | 阅读(221) |评论(0) | 阅读全文>>

搞笑巴神

2012-7-1 14:22:02 阅读190 评论0 12012/07 July1

北京时间6月29日凌晨,2012欧洲杯半决赛第2场比赛在意大利与德国之间展开,这场比赛巴洛特利成为了最闪耀的明星,正是他的两个精彩进球帮助意大利队挺进最后的决赛。从小组赛第一场单刀“思考人生”,再到与爱尔兰的惊世“神勾”,以及训练场上的诸多有趣画面,巴洛特利的欧洲杯之旅带给球迷们太多欢乐了。

作者  | 2012-7-1 14:22:02 | 阅读(190) |评论(0) | 阅读全文>>

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